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苹果手机自动清理短信后恢复默认设置的方法如下。
通过iCloud备份恢复
1、在苹果手机的设置中，找到并打开【通用】。
2、点击【还原】。
3、选择【从iCloud备份恢复】。
4、选择最近的备份时间并点击确认恢复，在此过程中需要连接Wi-Fi并等待一段时间来完成恢复，完成恢复后，短信应该会恢复到之前的状态。
方法二：使用第三方软件恢复
市面上有很多第三方软件可以恢复被清理的短信，例如数据蛙苹果恢复专家等，这些软件的使用方法大同小异，可以通过扫描手机或iTunes备份来恢复数据，但请注意，使用第三方软件可能存在风险，因此在使用之前请确保软件的来源可靠并谨慎操作。
方法三：关闭自动删除短信功能并手动备份重要短信以避免再次丢失
为了避免再次丢失重要短信，可以考虑关闭自动删除短信的功能并手动备份重要短信，可以通过以下步骤关闭自动删除短信功能：打开设置，找到信息应用，选择保留信息选项，然后选择保留所有信息或自定义保留时间，可以手动备份重要短信到电脑或其他云端存储设备上以防万一。
方法仅供参考，具体操作可能会因手机型号和系统版本的不同而有所差异，如果遇到困难或不确定如何操作，建议咨询苹果官方客服或寻求专业技术人员的帮助。